花卉在水培條件下安全越冬所需要的溫度條件與土壤栽培(人造介質栽培)所需要的溫度是一致的。水培花卉屬不耐寒性花卉，生長適溫一般為18℃25℃，當氣溫降至10℃以下時，有些花卉生長停滯，葉色失去光澤；低于5℃大多數觀葉植物會受到不同程度的傷害葉邊焦枯、老葉發黃、萎蔫脫落，甚至死亡。
在沒有調節環境溫度的設施及能力時，不妨選擇對溫度適應范圍較寬的花卉，如龜背竹、馬蹄蓮、常春藤、虎眼萬年青、君子蘭等花卉水培。另外，可用廢棄的泡沫塑料板，按照水培器皿外形尺寸的大小切割后，拼接粘合，將器皿包裹起來。室溫低于10℃時，在水培花卉上覆蓋舊報紙、塑料薄膜，或將水溫提高到18℃或25℃都有很好的效果。
冬季室溫低于10℃時，大多數水培花卉為適應惡劣的氣候條件處于休眠或半休眠狀態。此時應停止施用花卉水培營養液，只用自來水，并按時換水(換水時適當摻入一些溫水，使水溫保持在18～25℃左右)，清洗植株的根系，保持器皿清潔。一般10～15天更換一次新水，若水質清純潔凈，植株長勢健壯，沒有爛根，15～20天乃至30天更換一次也不會影響其生長。對那些仍處于緩慢生長的水培花卉，如君子蘭、馬蹄蓮等，可10－15天施用一次營養液，以促使其健康生長。
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